Yliopiston tulos on noin 9,3 miljoonaa euroa ylijäämäinen. Ilman sijoitustuottoja ylijäämää tulee kolme miljoonaa. 9,3 miljoonan ylijäämä on 4,2 prosenttia yliopiston kokonaisrahoituksesta. Rehtori Jukka Mönkkönen maalailee silti, että edessä on kovia aikoja. Tulossopimuskaudelle 2017-2020 on päätetty rahoitusleikkauksista, eikä Mönkkönen usko sijoitustoiminnasta enää saatavan yhtä suuria tuottoja.
Mönkkönen korostaa, että tulevat vuodet edellyttävät ”rakenteellista kehittämistä”. Yliopisto päätti vastikään luopua toiminnoistaan Savonlinnassa ja vähentää 120 työntekijää vuoteen 2020 mennessä.
Itä-Suomen yliopisto on koko historiansa ajan tehnyt ylijäämää. Vuodesta 2016 ennustellaan ensimmäistä alijäämäistä.